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Research Cooperation

科研合作

人类林奇综合征基因检测(高通量测序法)

项目背景


林奇综合征(Lynch Syndrome,LS)约占所有结直肠癌(CRC)的2%-4%[1],占所有子宫内膜癌(EC)的3%-5%[2]。LS主要由错配修复(MMR)基因的胚系突变引起,少见病例是位于MSH2上游的EPCAM基因3’端胚系缺失导致MSH2继发性表观突变的结果[3],与肿瘤组织中的错配修复缺陷(dMMR)/微卫星不稳定(MSI-H)有关。LS患者发生CRC和EC的风险较高,分别高达80%和60%,并且有发生其他癌症类型(如胃癌、小肠癌、尿路上皮癌和卵巢癌)的风险[4],飞朔生物与合作伙伴也报道了LS相关阴茎癌的病例[5]。各指南均推荐MMR免疫化学(IHC)或MSI筛查阳性,以及MLH1甲基化或BRAF V600E突变检测阴性的CRC、EC等肿瘤患者进行MMR基因胚系检测,以辅助LS的确诊[1,2,6]



子宫内膜癌LS筛查方法[6]



子宫内膜癌分子检测中国专家共识(2021年版)指出常规MMR/MSI检测联合BRAF V600E筛查会漏检10%的LS患者,可考虑采用高通量测序的方法替代常规MMR/MSI检测[2]。此外一些研究也提示与散发性肿瘤相比,LS相关肿瘤有更强的抗肿瘤免疫应答,使用免疫检查点抑制剂疗效更佳[7,8]


LS相关肿瘤免疫治疗疗效更佳[7,8]




[1] NCCN遗传性/家族性高风险评估-结直肠癌、子宫内膜癌、胃癌2024 v3

[2] 子宫内膜癌分子检测中国专家共识(2021年版)

[3] Front Oncol. 2022 Mar 4:12:856452.

[4] Genes (Basel). 2023 Nov 9;14(11):2060.

[5] Urol Int. 2024 Sep 2:1-5.

[6] CSCO子宫内膜癌诊疗指南2024

[7] Obstet Gynaecol. 2021 Jan;23(1):9-20.

[8] Cancer. 2022 Mar 15;128(6):1206-1218.



 检测项目


采用高通量测序法,胚系版检测MLH1、PMS2、MSH2、MSH6、EPCAM五个基因的编码区和外显子-内含子连接区,组织版检测以上五个基因加BRAF V600E突变。


项目名称

核心技术

项目规格

适配平台

样本类型

人类林奇综合征基因检测

RingCap®

16测试/盒

32测试/盒

Illumina

MGISEQ

肿瘤组织样本

对照样本

(全血、唾液、口腔拭子)


检测意义


1、辅助林奇综合征的确诊;

2、提示林奇相关肿瘤患者免疫治疗可能获益。


适用人群


1、任何肿瘤组织检测结果为dMMR/MSI-H的CRC、EC、胃癌等癌种患者,包含经MLH1甲基化、BRAF V600E检测阴性的患者;

2、肿瘤组织筛查结果为错配修复功能正常(pMMR)或微卫星稳定(MSS),但是临床高度怀疑LS的患者;

3、有血缘关系的家族成员确诊为LS者;

4、在肿瘤组织中检测到MMR基因致病性突变,但不能明确是否为胚系突变的患者;

5、可考虑采用组织版检测替代MMR/MSI筛查,可减少LS的漏检。



优势特点


检测全面:覆盖林奇综合征相关的MMR、EPCAM基因的编码区和外显子-内含子连接区;

取样灵活:可检测组织样本,组织版增加BRAF V600E突变检测,用以提示散发性结直肠癌;

灵敏度高:可检出25 ng DNA样本中含量低至1%的基因突变;

操作简单:采用RingCap®专利技术和八连管预分装试剂,建库方法简便。


操作流程


1、DNA提取

2、文库构建

3、上机测序

4、一键式数据分析

5、出具报告


检测服务流程


1、咨询相关事项0592-7578309

2、进行样本取样

3、样本快递至飞朔检测点

4、上机测序

5、出具报告

6、报告送出



——仅供科研参考使用——